Overview

Full Product Details

Author:   Gerhard Steger
Publisher:   Birkhauser Verlag AG
Imprint:   Birkhauser Verlag AG
Edition:   2003 ed.
Dimensions:   Width: 17.00cm , Height: 1.70cm , Length: 24.40cm
Weight:   0.722kg
ISBN:  

9783764369514

ISBN 10:   3764369515
Pages:   302
Publication Date:   01 April 2003
Audience:   Professional and scholarly ,  Professional & Vocational
Format:   Paperback
Publisher's Status:   Active
Availability:   Out of stock  
The supplier is temporarily out of stock of this item. It will be ordered for you on backorder and shipped when it becomes available.
Language:   German

Table of Contents

Strukturvorhersage von Nukleinsauren.- 1. Struktur und Funktion von RNA.- 1.1 RNA-Struktur.- 1.2 Thermodynamik der RNA-Faltung.- 1.3 Kinetik der RNA-Faltung.- 1.4 RNA-Struktur-Bestimmung.- 1.5 RNA-Funktionen.- 2. Kooperative Gleichgewichte in doppelstrangigen Nukleinsauren.- 2.1 Einfaches chemisches Gleichgewicht zwischen Isomeren.- 2.2 Protonierungsgleichgewicht.- 2.3 Modell fur Denaturierung von doppelstrangiger Nukleinsaure.- 3. Graphen und Alignments.- 3.1 Globales paarweises Alignment.- 3.2 Varianten des paarweisen Alignments.- 3.3 Kosten fur Lucken.- 3.4 Multiple Alignments.- 4. RNA-Sekundarstruktur-Vorhersage per Graphentheorie.- 4.1 Definition von Sekundar- und Tertiarstruktur.- 4.2 Tinoco-Plot.- 4.3 Zahl moeglicher Strukturen.- 4.4 Struktur mit maximaler Zahl Basenpaare.- 4.5 Strukturen mit submaximaler Zahl Basenpaare.- 4.6 Energie-Werte fur RNA-Sekundarstrukturen.- 4.7 Thermodynamisch optimale Sekundarstrukturen.- 4.8 Bestimmung von Strukturverteilungen.- 4.9 Qualitat der Vorhersage von Strukturen und Strukturverteilungen.- 4.10 Tertiarstrukturvorhersage.- 4.11 Simultane Optimierung von Struktur und Alignment.- 5. RNA-Sekundarstruktur-Vorhersage per Informationstheorie.- 5.1 Kommunikationstheorie.- 5.2 Sequence Logos : Darstellung der Information in Alignments.- 5.3 Expected mutual information rate oder rate of information transmission .- 5.4 Maximal gewichtete Zuordnungen.- 5.5 Optimierung der Konsensus-Struktur.- 5.6 Construct.- 6. RNA-Sekundarstruktur-Vorhersage mit Genetischen Algorithmen.- 6.1 Prinzip eines Genetischen Algorithmus.- 6.2 Beispiel fur Genetischen Algorithmus.- 6.3 Vorhersage von RNA-Sekundarstruktur.- 6.4 Vorhersage des Faltungswegs von RNA-Sekundarstruktur.- 6.5 Programmierter Zelltod durch hok/sok des Plasmids R1.- 7. RNA-Sekundarstrukturfaitung.- 7.1 Toleranzschwellen-Algorithmus.- 7.2 Sintflut-Algorithmus.- 7.3 Kinetische Parameter fur Strukturbildung.- 7.4 RNA-Faltung durch Loesung der master equation .- 7.5 Vorhersage von RNA-Faltung.- Strukturvorhersage von Proteinen.- 8. Protein-Struktur.- 8.1 Aminosauren als Bausteine.- 8.2 Die Polypeptidkette.- 8.3 Die Peptidbindung.- 8.4 Ramachandran-Plot.- 8.5 Sekundarstrukturen.- 8.6 Supersekundarstrukturen.- 8.7 Tertiarstrukturen.- 8.8 Folds und Superfolds, Familien und Superfamilien.- 8.9 Quartarstrukturen.- 9. Energetik von Protein-Strukturen.- 9.1 Nicht-kovalente Wechselwirkungen, die die Proteinstruktur bestimmen.- 9.2 Salzbrucken.- 9.3 Molekulare Packung.- 10. Protein-Sekundarstruktur-Vorhersage.- 10.1 Sekundarstruktur nach Chou & Fasman (1978).- 10.2 Sekundarstruktur nach Garnier et al. (1978).- 10.3 Hydropathie und Amphiphilie von ?-Helices.- 10.4 Antigenitatsindex nach Jameson & Wolf (1988).- 11. Qualitat von Vorhersagen.- 11.1 Eine binare Aussage oder eine Aussage mit Wertebereich.- 11.2 Aussagen mit mehr als zwei Klassen.- 11.3 Objektive Prufung von Vorhersagen.- 12. Vorhersage von Transmembran-Helices per Hidden-Markov-Modell.- 12.1 Markov-Ketten.- 12.2 Hidden-Markov-Modell.- 12.3 Hidden-Markov-Modelle zur Sequenz-Analyse.- 12.4 Transmembran-Helices per Hidden-Markov-Modell (TMHMM).- 12.5 Qualitat von Programmen zur Vorhersage von Transmembranregionen.- 13. Protein-Sekundarstruktur-Vorhersage per Neuronalem Netz.- 13.1 Neuronale Netze.- 13.2 PHD - Strukturvorhersage unter Verwendung evolutionarer Information.- 13.3 Ausgabebeispiel von PHD.- 13.4 Vorhersage von Signalpeptiden und Signalankern.- 14. Proteinfaltung mit ab-initio-Methoden.- 14.1 Elemente der ab-initio-Methoden.- 14.2 Stand der Forschung in MD-Simulationen.- 15. Inverse Proteinfaltung - Threading .- 15.1 3D-1D-Profile fur Threading.- 15.2 Verbesserungen des Algorithmus.- 15.3 Strukturvorhersage mit GenThreader.- 16. Proteinfaltung per Homologie-Modellierung.- 16.1 Identifizierung von verwandten Proteinen mit bekannter 3D-Struktur.- 16.2 Alignment der Target-Sequenz mit dem Template.- 16.3 Loop-Modellierung.- 16.4 Modellierung der Seitenketten.- 16.5 Fehler bei der Homologie-Modellierung.- 16.6 Modell-Bewertung.- Index zu Programmen.

Reviews

Author Information

Tab Content 6

Author Website:  

Customer Reviews

Recent Reviews

No review item found!

Add your own review!

Countries Available

All regions